Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCMTD2Q9NV79 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCMTD2Q9NV79 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD2Q9NV79 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms