Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMBRD1Q9NUN5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LMBRD1Q9NUN5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms