Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS00

C1GALT1, Glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1GALT1Q9NS00 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1GALT1Q9NS00 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1GALT1Q9NS00 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1GALT1Q9NS00 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms