Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO6Q9NRD1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms