Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVK-5Q9HDB9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms