Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BRMS1Q9HCU9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms