Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMYD3Q9H7B4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMYD3Q9H7B4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms