Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPF2Q9H7B2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPF2Q9H7B2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms