Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5V9

CXorf56, UPF0428 protein CXorf56, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf56Q9H5V9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXorf56Q9H5V9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXorf56Q9H5V9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXorf56Q9H5V9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXorf56Q9H5V9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXorf56Q9H5V9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXorf56Q9H5V9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXorf56Q9H5V9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXorf56Q9H5V9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXorf56Q9H5V9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXorf56Q9H5V9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXorf56Q9H5V9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXorf56Q9H5V9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXorf56Q9H5V9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXorf56Q9H5V9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms