Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms