Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYM8

RBCK1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBCK1Q9BYM8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBCK1Q9BYM8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBCK1Q9BYM8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms