Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABARAPL3Q9BY60 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms