Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR3CQ9BUI4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR3CQ9BUI4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR3CQ9BUI4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR3CQ9BUI4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR3CQ9BUI4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR3CQ9BUI4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR3CQ9BUI4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR3CQ9BUI4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR3CQ9BUI4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR3CQ9BUI4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR3CQ9BUI4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR3CQ9BUI4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR3CQ9BUI4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR3CQ9BUI4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR3CQ9BUI4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR3CQ9BUI4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR3CQ9BUI4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR3CQ9BUI4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR3CQ9BUI4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR3CQ9BUI4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR3CQ9BUI4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR3CQ9BUI4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR3CQ9BUI4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR3CQ9BUI4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms