Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTKNQ9BST9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTKNQ9BST9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms