Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCM2Q9BSQ5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCM2Q9BSQ5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCM2Q9BSQ5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCM2Q9BSQ5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms