Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC77Q9BR77 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms