Protein–RNA interactions for Protein: Q99748

NRTN, Neurturin, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRTNQ99748 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRTNQ99748 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRTNQ99748 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRTNQ99748 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRTNQ99748 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRTNQ99748 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRTNQ99748 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRTNQ99748 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRTNQ99748 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRTNQ99748 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRTNQ99748 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRTNQ99748 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms