Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PITX2Q99697 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms