Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPXM1Q96SM3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CPXM1Q96SM3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPXM1Q96SM3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CPXM1Q96SM3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPXM1Q96SM3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPXM1Q96SM3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms