Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIGSQ96S52 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms