Protein–RNA interactions for Protein: Q96RP7

GAL3ST4, Galactose-3-O-sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST4Q96RP7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAL3ST4Q96RP7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAL3ST4Q96RP7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAL3ST4Q96RP7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAL3ST4Q96RP7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GAL3ST4Q96RP7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAL3ST4Q96RP7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAL3ST4Q96RP7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAL3ST4Q96RP7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAL3ST4Q96RP7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms