Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU0

CNTNAP3B, Contactin-associated protein-like 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3BQ96NU0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP3BQ96NU0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP3BQ96NU0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms