Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT1

RNF145, RING finger protein 145, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF145Q96MT1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF145Q96MT1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF145Q96MT1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms