Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms