Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC17Q96LX7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC17Q96LX7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC17Q96LX7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms