Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ALPK3Q96L96 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
ALPK3Q96L96 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALPK3Q96L96 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ALPK3Q96L96 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms