Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC41A2Q96JW4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC41A2Q96JW4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms