Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms