Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CMTM5Q96DZ9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CMTM5Q96DZ9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CMTM5Q96DZ9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CMTM5Q96DZ9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTM5Q96DZ9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225 ms