Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERP27Q96DN0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERP27Q96DN0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERP27Q96DN0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERP27Q96DN0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERP27Q96DN0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERP27Q96DN0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERP27Q96DN0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERP27Q96DN0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERP27Q96DN0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERP27Q96DN0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERP27Q96DN0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERP27Q96DN0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERP27Q96DN0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERP27Q96DN0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERP27Q96DN0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
ERP27Q96DN0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERP27Q96DN0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERP27Q96DN0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERP27Q96DN0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 335.3 ms