Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C18orf8Q96DM3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C18orf8Q96DM3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms