Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TP53INP1Q96A56 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TP53INP1Q96A56 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms