Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBE2E3Q969T4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3Q969T4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms