Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA4DQ92854 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA4DQ92854 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms