Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR4A3Q92570 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms