Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCFD1Q8WVM8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCFD1Q8WVM8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237 ms