Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYRIPQ8NFW9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MYRIPQ8NFW9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYRIPQ8NFW9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms