Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC44A5Q8NCS7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SLC44A5Q8NCS7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.2 ms