Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM35BQ8NCS4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM35BQ8NCS4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM35BQ8NCS4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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