Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5C6

SRBD1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 995 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRBD1Q8N5C6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRBD1Q8N5C6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SRBD1Q8N5C6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRBD1Q8N5C6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms