Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4F7

RNF175, RING finger protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF175Q8N4F7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF175Q8N4F7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF175Q8N4F7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF175Q8N4F7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF175Q8N4F7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF175Q8N4F7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF175Q8N4F7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF175Q8N4F7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF175Q8N4F7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF175Q8N4F7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF175Q8N4F7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF175Q8N4F7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF175Q8N4F7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF175Q8N4F7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF175Q8N4F7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF175Q8N4F7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF175Q8N4F7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF175Q8N4F7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF175Q8N4F7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF175Q8N4F7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF175Q8N4F7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF175Q8N4F7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms