Protein–RNA interactions for Protein: Q8N114

SHISA5, Protein shisa-5, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA5Q8N114 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHISA5Q8N114 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHISA5Q8N114 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHISA5Q8N114 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms