Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00518Q8N0U6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00518Q8N0U6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms