Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT20Q8IY31 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT20Q8IY31 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT20Q8IY31 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms