Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL3Q8IVW4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL3Q8IVW4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms