Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASSF3Q86WH2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms