Protein–RNA interactions for Protein: Q86UP9

LHFPL3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHFPL3Q86UP9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHFPL3Q86UP9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms