Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC6BQ86SZ2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC6BQ86SZ2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms