Protein–RNA interactions for Protein: Q86SJ2

AMIGO2, Amphoterin-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO2Q86SJ2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMIGO2Q86SJ2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMIGO2Q86SJ2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMIGO2Q86SJ2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMIGO2Q86SJ2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMIGO2Q86SJ2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMIGO2Q86SJ2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMIGO2Q86SJ2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMIGO2Q86SJ2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMIGO2Q86SJ2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMIGO2Q86SJ2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMIGO2Q86SJ2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMIGO2Q86SJ2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms