Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 EIF3K-209ENST00000590134 711 ntTSL 27.77□□□□□ -1.179e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AFDN-210ENST00000423229 1807 ntTSL 1 (best)7.74□□□□□ -1.179e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.189e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 SLC25A28-204ENST00000496035 744 ntTSL 37.68□□□□□ -1.189e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AC087633.2-206ENST00000614581 513 ntTSL 57.55□□□□□ -1.29e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AC006206.2-201ENST00000537192 992 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.239e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TRIM66-203ENST00000481014 6505 ntTSL 27.14□□□□□ -1.279e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.279e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 KLHDC4-219ENST00000567513 585 ntTSL 47.12□□□□□ -1.279e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.289e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.289e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.289e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.39e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AC241952.1-202ENST00000637601 3404 ntTSL 26.85□□□□□ -1.319e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 RFWD2-206ENST00000461830 2131 ntTSL 56.72□□□□□ -1.339e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.339e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 SENP5-205ENST00000448068 484 ntTSL 26.51□□□□□ -1.379e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC6.46□□□□□ -1.389e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.389e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 IMMP2L-209ENST00000489381 856 ntTSL 56.36□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.399e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.34□□□□□ -1.399e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.49e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 RCHY1-205ENST00000505514 1089 ntTSL 56.26□□□□□ -1.419e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 FBXW11-211ENST00000522891 819 ntTSL 36.26□□□□□ -1.419e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.429e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 FANCI-215ENST00000568670 285 ntTSL 36.02□□□□□ -1.459e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 RCHY1-209ENST00000513083 540 ntTSL 1 (best)5.98□□□□□ -1.459e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.459e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TTC32-204ENST00000495698 710 ntTSL 25.88□□□□□ -1.479e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 RFWD2-202ENST00000367666 2022 ntTSL 25.68□□□□□ -1.59e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PTP4A2-207ENST00000494444 678 ntTSL 55.63□□□□□ -1.519e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PTP4A2-202ENST00000468531 830 ntTSL 35.6□□□□□ -1.519e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.58□□□□□ -1.529e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.539e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AC112178.1-202ENST00000446720 427 ntTSL 35.45□□□□□ -1.549e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 SLC20A1-207ENST00000490674 3202 ntTSL 1 (best)5.44□□□□□ -1.549e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ZNF782-201ENST00000289032 2355 ntTSL 25.44□□□□□ -1.549e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 RCHY1-211ENST00000513909 728 ntTSL 35.25□□□□□ -1.579e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.579e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.69e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.632e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 RCHY1-204ENST00000505105 1304 ntTSL 1 (best)4.86□□□□□ -1.639e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.669e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.664e-10■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PSMD1-212ENST00000491229 546 ntTSL 24.63□□□□□ -1.674e-10■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 RCHY1-212ENST00000514021 436 ntTSL 34.52□□□□□ -1.699e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 FANCI-205ENST00000563250 700 ntTSL 54.34□□□□□ -1.719e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.749e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 FANCI-210ENST00000565522 233 ntTSL 53.79□□□□□ -1.89e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AHI1-203ENST00000367799 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)2.91□□□□□ -1.949e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TRPM7-205ENST00000560638 2518 ntTSL 1 (best)2.74□□□□□ -1.979e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 KNL1-203ENST00000526913 5584 ntTSL 1 (best)1.6□□□□□ -2.154e-7■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.34e-9■■■■■ 29.5
LARP4Q71RC2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 29.5
LARP4Q71RC2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 29.5
LARP4Q71RC2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 29.5
LARP4Q71RC2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 29.5
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-219ENST00000636942 1696 ntTSL 520.41■□□□□ 0.864e-8■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-225ENST00000637563 2622 ntTSL 518.6■□□□□ 0.574e-8■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-206ENST00000635937 3078 ntTSL 516.75■□□□□ 0.274e-8■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-229ENST00000637978 1758 ntAPPRIS P5 TSL 515.83■□□□□ 0.124e-8■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-216ENST00000636660 1126 ntTSL 512.36□□□□□ -0.434e-8■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.345e-6■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 TUSC2-205ENST00000462137 834 ntTSL 320.34■□□□□ 0.858e-8■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 TUSC2-204ENST00000454201 735 ntTSL 519.88■□□□□ 0.778e-8■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.698e-8■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 TUSC2-206ENST00000463304 475 ntTSL 218.04■□□□□ 0.488e-8■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 DPM2-205ENST00000495270 1662 ntTSL 1 (best)16.87■□□□□ 0.298e-8■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.285e-6■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.265e-6■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 TUSC2-203ENST00000421918 790 ntTSL 516.62■□□□□ 0.258e-8■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.185e-6■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 CRELD2-210ENST00000487969 2622 ntTSL 215.81■□□□□ 0.125e-6■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.078e-8■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.168e-8■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.758e-8■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 SRCAP-202ENST00000395059 9126 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.788e-8■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.218e-8■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.228e-8■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 SNRPD1-204ENST00000582475 723 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.614e-8■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.144e-8■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.612e-9■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 LSM2-214ENST00000493387 767 ntTSL 510.93□□□□□ -0.662e-9■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 LSM2-212ENST00000477182 767 ntTSL 310.87□□□□□ -0.672e-9■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 LSM2-209ENST00000470083 641 ntTSL 210.65□□□□□ -0.72e-9■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 LSM2-213ENST00000491421 820 ntTSL 37.53□□□□□ -1.22e-9■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 LSM2-210ENST00000470086 713 ntTSL 27.15□□□□□ -1.262e-9■■■■■ 29.4
LARP4Q71RC2 PCBD1-202ENST00000493228 732 ntTSL 213.43□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 29.3
LARP4Q71RC2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.024e-8■■■■■ 29.3
LARP4Q71RC2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.154e-8■■■■■ 29.3
LARP4Q71RC2 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.322e-18■■■■■ 29.2
LARP4Q71RC2 HERC2P3-208ENST00000430598 4279 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.367e-7■■■■■ 29.2
LARP4Q71RC2 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.67e-7■■■■■ 29.2
LARP4Q71RC2 HERC2P3-205ENST00000428453 4383 ntTSL 210.32□□□□□ -0.767e-7■■■■■ 29.2
LARP4Q71RC2 HERC2P3-209ENST00000437318 4161 ntTSL 1 (best)7.78□□□□□ -1.167e-7■■■■■ 29.2
LARP4Q71RC2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.74■■□□□ 1.231e-6■■■■■ 29.2
LARP4Q71RC2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 29.2
LARP4Q71RC2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 29.2
LARP4Q71RC2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.573e-12■■■■■ 29.1
Retrieved 100 of 15,922 protein–RNA pairs in 542.8 ms